Câu lạc bộ

Năm 12 tuổi, Lee Nguyen trúng tuyển vào U-13 Dallas Texans, tại đây anh được dìu dắt bởi cựu đội trưởng Iran Hassan Narazi. Trong 5 năm ở Dallas Texans, Lee Nguyễn giúp đội bóng trẻ này vô địch Dallas Cup - giải trẻ quy tụ những đội U-18 hàng đầu từ châu Âu và Nam Mỹ. Năm 2004, trong màu áo trường trung học Plano East, Lee Nguyen được bình chọn là Cầu thủ Trung học xuất sắc nhất nước Mỹ.[3] Năm 2005, Lee Nguyen gia nhập đội bóng đá của trường Đại học Indiana và được bầu là Cầu thủ sinh viên hay nhất nước Mỹ.[4]

Tháng 2 năm 2006, anh chuyển sang châu Âu thi đấu cho câu lạc bộ Hà Lan PSV Eindhoven, khi đó đang được dẫn dắt bởi huấn luyện viên Guus Hiddink.

Tháng 10 năm 2008, Lee Nguyen tỏ ý muốn về Việt Nam thi đấu cho câu lạc bộ Hoàng Anh Gia Lai. Ngày 17 Tháng 1 năm 2009, Lee Nguyễn chính thức là cầu thủ của Hoàng Anh Gia Lai, anh khoác áo số 24 tại câu lạc bộ này và được dẫn dắt bởi huấn luyện viên Kiatisuk Senamuang. Mức lương của anh khi đó tại đội bóng Phố Núi là 10.000 USD/tháng.[5] Và một trong những điều kiện để Lee Nguyễn đặt bút ký hợp đồng với Hoàng Anh Gia Lai, bên cạnh chuyện tài chính, còn là phụ lục về việc câu lạc bộ sẽ tạo điều kiện cho anh tập huấn và thử việc 1 tháng tại Arsenal sau khi V-League 2009 kết thúc. Tuy nhiên, về phía Hoàng Anh Gia Lai, bầu Đức thực sự không muốn mất cầu thủ mà ông dày công chiêu mộ về Pleiku và đã chơi ấn tượng ở mùa giải đầu tiên tại Việt Nam. Chính vì vậy, thay vì cấp kinh phí một tháng cho Lee Nguyễn tập huấn ở Arsenal, đội bóng phố núi chỉ cấp cho 2 tuần.[6] Anh có trận đấu đầu tiên vào ngày 1 tháng 2 năm 2009 trong trận tiếp Sài Gòn United tại Cúp quốc gia. Trong trận này, Lee Nguyen lập cú hattrick giúp Hoàng Anh Gia Lai thắng 3–2.

Chỉ một năm sau, anh chuyển sang thi đấu cho câu lạc bộ Becamex Bình Dương nhưng cũng không thành công. Giải thích về thất bại của Lee Nguyễn tại V-League, HLV Nguyễn Thành Vinh cho rằng: "Chính lối đá bạo lực theo kiểu chém đinh chặt sắt đã “giết chết” Lee Nguyễn".[7]

Sau thời gian không thành công ở Việt Nam, Lee Nguyen trở về giải bóng đá nhà nghề Mỹ (MLS) khoác áo câu lạc bộ New England Revolution từ năm 2012 và chỉ nhận được một số tiền lương ít ỏi tương ứng với một cầu thủ học việc.[8] Tại Mỹ anh thi đấu rất tốt và được bầu chọn vào đội hình xuất sắc nhất mùa giải MLS 2014.[9] Theo trang web của FIFA, Lee Nguyen là một trong những tiền vệ kiến thiết hay nhất của MLS.

Vào tháng 5 năm 2018, vì có một số vấn đề với New England Revolution về mức lương nên anh chuyển sang câu lạc bộ Los Angeles.

Quốc tế

Năm 2005, sau khi được bầu là Cầu thủ sinh viên hay nhất nước Mỹ, Lee Nguyen được gọi vào đội tuyển U-20 Hoa Kỳ tham dự giải vô địch bóng đá trẻ thế giới tại Hà Lan.

Ngày 2 tháng 6 năm 2007, Lee Nguyen được gọi vào đội tuyển quốc gia Hoa Kỳ trong trận giao hữu thắng Trung Quốc 4–1 trên sân vận động San Jose, California. Cũng trong năm 2007, anh cùng đội tuyển quốc gia Hoa Kỳ tham dự giải Copa America 2007. Tại giải đấu này, anh có 2 lần vào sân thay người trong trận gặp Paraguay và Colombia.

Đầu năm 2015, Lee Nguyen được gọi trở lại đội tuyển quốc gia Hoa Kỳ sau một năm thi đấu thành công ở câu lạc bộ New England Revolution. Năm 2016, anh có 2 lần vào sân thay người vào 2 trận giao hữu trước khi giã từ đội tuyển cùng năm đó.